Mecanisme Optimal de Recherche de Cible Des Proteines Sur L'Adn : Étude de l'enzyme de restriction EcoRV en microscopie de fluorescence à l'échelle de la molécule unique

Bok av Isabelle Bonnet
Comment certaines protines sont-elles capables de trouver trs rapidement sur des ADNs pouvant contenir plusieurs milliers de paires de bases une cible spcifique de quelques paires de base? Cette "diffusion facilite" ncessite une association de la protine l'ADN, suivie d'un dplacement jusqu'au site de reconnaissance: la protine glisse-t-elle long de l'ADN ? Ou effectue-t-elle des sauts? L'utilisation de la microscopie de fluorescence pour visualiser l'interaction d'une unique protine (l'enzyme de restriction EcoRV) avec une molcule d'ADN a permis d'lucider les mcanismes qui sous-tendent cette "diffusion facilite". Nous avons montr que la protine glisse 1D le long de l'ADN et que ce glissement est entrecoup de sauts 3D. Un modle bas sur les observations exprimentales montre que l'intermittence des processus 1D/3D minimise le temps de recherche de la protine. Cette premire visualisation de la diffusion facilite des protines (glissement et saut) constitue une avance majeure dans la comprhension des processus de recherche de cible.