Signature G�nomique de 3 �cotypes d'Ostreococcus, Algues Prasinophytes

Bok av Jancek-S
Le genre Ostreococcus regroupe les plus petits organismes eucaryotes photosynthtiques connus ce jour. Les gnomes complets de 3 cotypes d'Ostreococcus, isols partir de 3 niches cologiques diffrentes, ont t squencs. Ces cotypes correspondent une souche de surface adapte une forte luminosit, une souche profonde adapte une faible luminosit, et une souche de surface polyvalente la lumire. La comparaison des gnomes a rvl une divergence en acides amins inattendue entre les gnes orthologues (70% d'identit) alors que leurs squences 18S ont une identit de 99%. La divergence entre ces 3 souches a t compare avec les divergences de 4 lignes eucaryotes, et souligne le fait que le gne marqueur 18S sous-estime la divergence globale des organismes unicellulaires. La comparaison gnomique des 3 Ostreococcus a permis d'identifier les fonctions des gnes orthologues et des gnes spcifiques. L'estimation des taux de substitution entre orthologues a permis d'identifier des gnes candidats l'origine de l'adaptation de ces organismes leur environnement, et suggre un rle majeur des protines transmembranaires dans l'volution de ces espces.